La magistrada Linares fue electa para presidir la JEP por el comité que escogió a los magistrados de este sistema de justicia transicional surgido del Acuerdo de Paz entre el Gobierno y las Farc. Venía de ser consultora del Centro Nacional de Memoria Histórica desde 2013 y asesora jurídica de la Contraloría desde 2015, su experiencia más reciente en una carrera dedicada a los temas de género y derechos humanos.

Ha trabajado para el Fondo Global para la Paz y Seguridad de la Embajada de Canadá (2011-2012) en el análisis de las versiones libres del sistema de Justicia y Paz, creado en 2005 para la desmovilización de las AUC; para ONU Mujeres en la formulación de una política interna de género en la Defensoría del Pueblo (2009-2010); para la Unidad de Memoria del Archivo Histórico de Bogotá, el Fondo de Población de las Naciones Unidas, el DANE y el Consejo Noruego para los Refugiados. Y fue directora del Instituto de Estudios del Ministerio Público y procuradora delegada para los Derechos Humanos y Asuntos Étnicos (2001-2009).